При открытии фирмы, Вы должны были указывать ОКВЭД. Дак вот, если у Вас организация грузоперевозок-то это либо ОСНО либо УСНО, если Вы еще и прописали "Деятельность грузового транспорта"-то это ЕНВД, сюда и отнесете свой автомобиль. Таким образом Вы будете платить налоги и по ОСНО и по ЕНВД. Только нужно вести раздельный учет, и не смешивать!