Как вариант, фирма, оплатившая Вам рейс пишет на фирменном бланке письмо с просьбой считать оплату по такому-то счету за фирму такую-то, ставит свою печать и Вы это письмо (нужен оригинал с синей печатью, а не просто скан) подкладываете к выписке банка.
Либо перезаключаете договор и заявку с другой фирмой и в счете в 1С меняете заказчика.