Мы ИП на ЕНВД, тоже есть работники, использую онлайн сервис "Мое Дело" https://www.moedelo.org, Мне нравится, сервис помогает правильно вести бухгалтерский учёт, рассчитывать налоги (взносы) и уплачивать их точно в срок, а также сдавать электронную отчётность.
— расчёт налогов;
— формирование отчётности и отправка через интернет;
— создание счетов, актов, накладных, договоров;
— учёт доходов и расходов;
— экспертные консультации;
— расчёт зарплат.
Если я не ошибаюсь, то там же можно бух.учет и для ООО вести